Az élet kódjai

Már eddig is voltak eszközök, hogy a megtalált SNP-khez, indelekhez biológiai hatást rendeljenek, de ezek legtöbbje kimerült a szinoním, nem-szinoním mutációk elkülönítésében. Más eszközök, mint amilyen az Annovar is, csak a modell organizmusokra koncentrálnak és tetemes energia befektetésre van…

Bioinformatikai munkafolyamatok (szaknyelven pipeline-ok) fejlesztésére a legegyszerűbb módszer még mindig a parancssori szkriptek írása. Az irányítás végig a kezünkben van, minden lépést aprólékosan felépíthetünk. Az adatok sokszínűsége viszont olyan potenciális hibaforrásokat hordozhat, ami a…

Jobb ha van, de ha nincs, akár egy cikk is születhet belőle. Pontosan ez történt ugyanis a legújabb publikációnknál. A búza mikroRNS szekvenáláshoz a könyvtár előkészítést egy PhD hallgatónak kellett volna csinálni, de az egyik szenior kutató úgy gondolta, bölcsebb, ha nem tesz fel mindent egy lapra…

– Professzor úr, mit csinál!? – kérdezte Gergő, a tanítványa. Még meg sem itta a reggeli kávéját, el sem olvasta a levelezést, de mestere már a laborban ugrált a Petri csészék között. – Egy szép új világot! – hangzott a cseppet sem szerény válasz. – Most végre meg tudom csinálni! – Mit? – kérdezte…

Most már tényleg le kellene állni a projekt harácsolásról. Az egyik PhD hallgató megkeresett, hogy van 105 RNA-seq adata organoidokból. Az organoidok olyan ős sejtekből differenciáltatott szövet kezdemények, melyek hordozzák a végső szövet lényeges tulajdonságait. Miért érdekes ez? Amíg egy embert…