HTML

Az élet kódjai

Csináld maga. Senki nem csinálja meg helyetted.

Friss topikok

Klaszter adminisztráció

2017.01.29. 01:37 Travis.CG

A klaszter adminisztráció nem egyszerű feladat. Emlékszem, még az egyetem alatt az egyik tanár mesélte az új labor felállításáról, hogy a telepítést úgy oldották meg,  hogy egy gépre elvégezték, majd a dd paranccsal a többi gép merevlemezére másolták azt. Nyilván, ha egyforma gépeink vannak, azokat…

Szólj hozzá!

Címkék: rendszergazda cloud computing

A dolgok mélysége

2017.01.23. 01:36 Travis.CG

Kijött az idei első cikk! Az elemzés egyik lépéséről már készült egy korábbi poszt. A vizsgált régióra még a tesztelésre megkapott egyik MinION-t is ráengedtük, de nem volt elég nagy a lefedettség, hogy bármi érdemi eredményt kapjunk. Amilyen gyors volt a bioinformatikai elemzés, a kísérletes…

Szólj hozzá!

Címkék: publikáció

Elixir

2017.01.19. 02:42 Travis.CG

Hétfő óta nincs víz a lakásban. Ha megnyitom a csapot, csak valami furcsa hang jön ki rajta: MagyarországcsatlakozottazElixirhezMagyarországcsatlakozottazElixirhez... Előző évben egy buszos beszélgetés alkalmával kiderült, hogy az Elixir egyik adminisztrátorával szoktam utazni. Mikor megtudta, hogy…

Szólj hozzá!

Majdnem mindent az RNA-seq-ről (4.rész)

2017.01.16. 00:58 Travis.CG

Az illesztést követően meg kell határozni, hogy a vizsgált régiókra mennyi read esik. A vizsgált régió lehet gén, transzkript, de akár exon is. Annak ellenére, hogy ez első látásra egy egyszerű feladat, hamar érdekes kérdésekre kell választ adnunk. A régiók ugyanis átfedhetnek. Antiszensz…

Szólj hozzá!

Címkék: bioinformatika

Fájltalan, szervertelen...agyatlan?

2017.01.11. 01:07 Travis.CG

A cím kicsit félrevezető. A fájl nélküli (filess) nem azt jelenti, hogy nincsenek fájlok. A szerver nélküli (serverless) esetén se gondoljunk arra, hogy a szolgáltatások a semmin futnak. A két koncepció csupán annyit jelent, hogy a fájlok és szerverek, mint elsődleges célok megszűnnek és helyüket…

Szólj hozzá!

Címkék: cloud computing

Év végi összefoglaló

2017.01.01. 01:11 Travis.CG

Az idén sem lehet ok a panaszra. Megjelent öt cikk, ami nem is rossz. Feldolgoztam 980 egysejtes RNA-seq-t (egy PhD hallgatónak kellett segíteni a dissszertációjához), 40 organoid RNA-seq-t, 1085 sejtvonalból származó RNA-seq-t (az RNA-seq pipeline teszteléséhez kellett), 196 egysejtes fitymabőr…

Szólj hozzá!

Címkék: filozofálás

süti beállítások módosítása