Bioinformatika 2023
2023.11.13. 22:56 Travis.CG
Megrendezték a szokásos évi bioinformatikai konferenciát. Idén egyáltalán nem volt AphaFold, nem voltak rendezetlen fehérjék, viszont tanulóalgoritmusok dögivel. Most kevesebb csoportvezető adott elő, úgyhogy nem voltak töltelék előadások, hanem valódi munkákat mutattak be. Érdekes módon több céges…
Szólj hozzá!
Címkék: bioinformatika
Minden, amit a CellRangerről tudni akartál, de féltél megkérdezni
2023.03.06. 17:58 Travis.CG
Szólj hozzá!
Címkék: bioinformatika
Befuccsolt ötletek 2: Apró programok Go-ban
2023.01.11. 13:32 Travis.CG
Mikor elkezdtem tanulni a Go-t, egyszerű kis progikkal kezdtem, amik megkönnyítették valamely munkafolyamat egy lépését. Az idők során összefogtam őket BUG néven, utalva rá, hogy a tanulás korai szakaszában még nem ment minden zökkenő mentesen. Ahogy gyarapodtak a programok, úgy elkezdett érlelődni…
2 komment
Címkék: bioinformatika
Bioinformatics and Data Science in Genomic Studies 2022 konferencia
2022.12.05. 08:19 Travis.CG
Szólj hozzá!
Címkék: bioinformatika
Galaxy - a bioinformatika jövője akar lenni, de nem az
2022.10.25. 08:03 Travis.CG
Szólj hozzá!
Címkék: bioinformatika
Ha már adatot osztunk meg...
2022.07.20. 22:27 Travis.CG
Szólj hozzá!
Címkék: életmód bioinformatika
Megkövesedett tudás
2022.04.05. 10:10 Travis.CG
Pontosan nem emlékszem, hol hallottam, hogy a cikkek leírják, amit két évvel ezelőtt tudtunk. A könyv leírja, amit 5-10 évvel ezelőtt tudtunk, az egyetemi oktatásban pedig megjelenik, amit 20 évvel ezelőtt tudtunk. Habár az itt leírt számok változhatnak, az tény, hogy az oktatott anyagban mindig van…
Szólj hozzá!
Címkék: bioinformatika
Ez most nem vicc: teljes humán genom
2022.04.01. 07:55 Travis.CG
Ami évekkel ezelőtt még április 1 ugratásnak indult, ma már valóság. Megvan a teljes humán genom minden egyes nukleotidja. Úgy is mondhatnánk, hogy idén az a poén, hogy volt régen egy poén, ami többé nem poén. A Science egy teljes számot szentelt a témának, de akit érdekel a dolgok háttere, annak a…
2 komment
Címkék: bioinformatika
Differenciál expresszió felülvizsgálva
2022.03.22. 10:53 Travis.CG
Szólj hozzá!
Címkék: bioinformatika
Minden, amit az Illumina programokról tudni akartál
2022.02.01. 08:57 Travis.CG
Az utóbbi időben játszottam egy keveset az Illumina saját fejlesztésű programjaival. Ez idő alatt sokszor eszembe jutott a régi vicc, csak Szadlacsek helyett az Illumina nevével. Az Illumina a TSO 500 paneljéhez egy saját alkalmazást is fejlesztett, ami a felhős körnezetében, a BaseSpace-en fut. Ez…
Szólj hozzá!
Címkék: bioinformatika
Az ökológusok módszereitől ments meg, Uram, minket!
2021.12.24. 23:19 Travis.CG
Szólj hozzá!
Címkék: bioinformatika
A haplitípus-hazugság
2021.02.22. 08:00 Travis.CG
Az ember diploid élőlény, ami azt jelenti, hogy a teljes kromoszóma készletéből kettő van. Egy anyai és egy apai eredetű. Ha csak a legegyszerűbb DNS változásokat, a nukleotid variációkat nézzük, akkor ez azt jelenti, hogy ha megnézzük egy egyén SNP-it, akkor azt jó eséllyel megtalálhatjuk legalább…
Szólj hozzá!
Címkék: bioinformatika
Hi-C elemzés
2021.01.10. 21:32 Travis.CG
Habár előszeretettel hivatkoznak a DNS láncra, mint egy hosszú szalagra, ahol csak a nukleotidok sorrendje az egyedüli fontos ismertetőjegy, a valóságban a DNS egy komplex struktúra, ahol külön logisztikát igényel a sejttől, hogy ezt az információt valahogy tárolja. A DNS ezért nem egy összekuszált…