HTML

Az élet kódjai

Csináld maga. Senki nem csinálja meg helyetted.

Friss topikok

  • sdani: @Travis.CG: Nohát, nem is tudtam, hogy ilyen van... bár ahogy elnézem ezek a komponensek fizetősek... (2018.11.01. 10:14) Rossz beidegződések a bionformatikában
  • Csenge Tarnói: Ez érdekes. Most csinálok egy meta-analízist, életemben először, úgyhogy az én tudásom is felszíne... (2018.10.01. 21:39) Ez már nekem sok
  • robertherczeg: Nekem a kedvenc az volt, hogy: "Inkább eleve Mann-Whitney és/vagy Wilcoxon tesztet használjunk, m... (2018.09.04. 07:47) Ezért utálom a Wilcoxon-tesztet
  • Travis.CG: ÉÉÉÉÉs megjelent! (2018.08.24. 23:31) Nehéz szülés 2
  • Szedlák Ádám: Hogy én mennyire köszönöm ezt a posztot, arra nincs szó. A kódoljon mindenki / legyen mindenki olc... (2018.06.25. 03:37) Legyen mindenki programozó

UTGB genom böngésző

2010.11.24. 13:54 Travis.CG

Mai alkalommal az UTGB-t veszem górcső alá. A program minden Java fejlesztő álma lehet, mert Mavent, Tomcatet is használ. A honlap szerint képes leszek pár perc alatt genom böngészőt varázsolni a gépemre. A korábbi bejegyzésem az EnsEMBL-től megmutatja, hogy ott a telepítés igencsak fájdalmas és hosszadalmas lehet. Nézzük, mire is képes ez a kis program.

A telepítésnél lehetőség van egy klikkeléssel a gépünkre rakni Java Web Starttal. Mivel én felhőre akarok telepíteni, csak a manuális munka jöhet szóba. Pedig milyen jó lenne, ha egy klikkeléssel megcsinálná helyettem! :-)

Komolyra fordítva a szót: Le kell tölteni egy zip fájlt, és a dokumentáció szerint eljárni. Valóban gyorsan és egyszerűen lehet telepíteni. Az első projekt létrehozása sem bonyolultabb, mint GWT-ben. Elkészül egy könyvtárstruktúra. Ebbe bele kell lépni a további műveletek végett. Az első fordítás viszont a Mavennek hála letölt egy csomó Javas csomagot. Ez persze nem baj. Bizonyára mások sem szeretnek a különböző függőségekkel bajlódni. Fordítás után elindítjuk a szervert, mire az utgb még több csomag letöltésébe kezd. Végül elindul, és a portable Tomcat nem válaszol. Ezen nem is kell csodálkozni, rendbe kell hozni.

Igen, az Amazonos gép portja nem volt nyitva. Miután korrigáltam, szépen meg is jelenik a teszt oldal. Mivel Java-s alkalmazásról van szó, nem csoda, hogy Eclipse nélkül nem lehet birizgálni a forráskódot. Legalábbis a készítők szerint. Az Amazonos virtuális gépen nincs X, ezért ez számomra nem opció. Nincs is rá szükség. A lényeg az src könyvtárban található.

Szólj hozzá!

Címkék: bioinformatika

A bejegyzés trackback címe:

https://cybernetic.blog.hu/api/trackback/id/tr582470211

Kommentek:

A hozzászólások a vonatkozó jogszabályok  értelmében felhasználói tartalomnak minősülnek, értük a szolgáltatás technikai  üzemeltetője semmilyen felelősséget nem vállal, azokat nem ellenőrzi. Kifogás esetén forduljon a blog szerkesztőjéhez. Részletek a  Felhasználási feltételekben és az adatvédelmi tájékoztatóban.

Nincsenek hozzászólások.