Az idén sem lehet ok a panaszra. Megjelent öt cikk, ami nem is rossz. Feldolgoztam 980 egysejtes RNA-seq-t (egy PhD hallgatónak kellett segíteni a ...
Kit vegyünk be a cikkbe?
Vége a hosszú, fáradságos munkának. Kész a kézirat is. A munkatársak, akik eddig együtt, vállvetve kutatták az ismeretlent, hirtelen ellenségekké ...
Algoritmikus Karácsonyi Ünnepeket
Az egyik csoportvezetőnek YouTube nézés közben támadt az az ötlete, hogy karácsonyi dalokat algoritmizáljunk. Amolyan börtönös karatefilm ...
Jegyzeteljünk
Mikor elkezdtem a PhD-t, témavezetőm adott egy hatalmas füzetet és elmagyarázta, hogyan kell jegyzőkönyvet vezetni: minden nap új oldalt kezdeni, ...
Virtu...virtu...virtualizáció!
Már nagyon ritka, hogy egy munkafolyamathoz csak egyetlen programot használunk. Sok programot, sok különböző beállítást használunk, gyakran ...
Majdnem mindent az RNA-seq-ről (3.rész)
Illesztés
Elérkeztünk az RNA-seq legvitatottabb lépéséhez, az illesztéshez. Bárkivel beszéltem eddig RNA-seq-ről, mindenkinek megvolt a jól bejáratott ...
Nyerő páros
Toby mindig meglepődött, ha a hülyeség váratlan helyen bukkant fel. Nem kellett volna neki. Negyvenkét évesen épp elég tapasztalata lehetett volna, ...
Kruskal-Wallis kisiparos
Miután kiderült, hogy némi R szkripteléssel klikkelések ezreit tudom megspórolni , újabb búzás megbizatást kaptam. Maga a számítás nem volt ...
Túlprogramozás
Egyszer volt, hol nem volt, valahol a CRT monitorok idején, de még a tapicskolós mobiltelefonok megjelenése előtt, a Napster fénykorában, volt egy ...
Majdnem mindent az RNA-seq-ről (2.rész)
QC
A szekvenálás minőségének meghatározása szinte teljesen megegyezik a DNS szekvenálásnál alkalmazott módszerekkel. Ez nem is meglepő, hiszen ...