A bioinformatika szépségei (és szörnyetegei)
2020.09.29. 21:58 Travis.CG
Szólj hozzá!
Címkék: bioinformatika
Többszörös illesztés
2020.08.25. 22:21 Travis.CG
A többszörös illesztés régen egyszerű volt. Fogtuk a szekvenciákat, bedobtuk a ClustalW-be és illesztettünk. Később jött a Mafft, Muscle és a társai, de a recept nem változott sokat. A szekvenciák aztán hosszabbodtak és már mindenki genomokat akart illeszteni ezresével. Nem csak az aktuális járvány…
Szólj hozzá!
Címkék: bioinformatika
Szokatlan programozási nyelvek a bioinformatikában
2020.08.02. 22:52 Travis.CG
Szólj hozzá!
Címkék: bioinformatika
Az elveszett FASTA fájlok nyomában
2019.11.10. 22:16 Travis.CG
Réges-régen az elérhető nukleotid szekvenciákat csak az NCBI-ról töltöttem le. Ez egyszerű volt és működött. Egy adatbázis rekord egyetlen szekvenciát foglalt magába. Ahogy szaporodtak a tárolandó adatok, úgy kezdett egyre összetettebb lenni a rendszer. A genom szekvenálásokkal mindez megváltozott.…
Szólj hozzá!
Címkék: bioinformatika
Molekula azonosítóval a szekvenálási hibák ellen
2019.08.11. 21:40 Travis.CG
A variációk azonosítása a kutatásban nem bonyolult feladat. Elég régóta fejlesztenek megoldásokat és javítják a meglévőket. Bár a mutációk detektálási pontossága nem 100%, a mintaszám növelésével meg lehet találni azokat a mutációkat, amelyek egy jó publikációhoz elegendőek. A klinikai diagnosztika…
Szólj hozzá!
Címkék: bioinformatika
Hülye bioinformatikai programok
2019.04.01. 00:06 Travis.CG
Rendhagyó módon, április elseje alkalmából nem egy álhírt készítek, hanem valódi hülyeségeket mutatok be a bioinformatika világából. Nevezetesen a hülye programokat. Mitől lesz egy program hülye? Három okból is: Az első ok, hogy használhatatlan az adott feladatra, amire megalkották. Nem azért, mert…
Szólj hozzá!
Címkék: bioinformatika
Uszítsd rá a Krakent! A metagenomra.
2019.01.12. 23:42 Travis.CG
Szólj hozzá!
Címkék: bioinformatika
Bioinformatika a Magyar Tudomány Ünnepén
2018.11.26. 00:07 Travis.CG
Szólj hozzá!
Címkék: bioinformatika
Rossz beidegződések a bionformatikában
2018.10.30. 23:10 Travis.CG
Úgy általában a kutatásról elmondható, hogy nem jellemzi egységes megoldási rendszer, még olyan alapvető problémákra sem, amire egy céges környezetben esetleg évek óta van bejáratott protokol. Ezért van az, hogy míg egy dolgozó egyik cégtől átmegy egy másikba, ismerős szoftverekkel, környezettel fog…