HTML

Az élet kódjai

Csináld maga. Senki nem csinálja meg helyetted.

Friss topikok

  • sdani: Sajnos nekem is hasonló érzéseim vannak az R kiszorulásával kapcsolatban. Remélem jobban fogja tar... (2024.04.29. 10:48) R meetup
  • sdani: Nagyon jók ezek a bejegyzések! Feszültséggel teli, fordulatos, mint egy jobb krimi. :D Abba ne hag... (2024.04.29. 10:35) Wgel CTF
  • sdani: @Travis.CG: Egy kis szerencse sosem árt. :D (2024.03.01. 13:19) A bioinformatika helyzete 2024-ben
  • Travis.CG: Szóval az akadémiai szféra mazochistává tett, amit a Pinephone-al élek ki? Hmm, érdekes összefüggé... (2023.10.05. 18:23) Új barátom az Informatikai titkárságról
  • Travis.CG: Túl nagy a hype körülötte, ezért túlzó elvárások vannak vele szembe. Ha a korábbi chatbotokhoz kép... (2023.02.28. 06:28) chatGPT, a bioinformatikus

R meetup

2024.04.19. 11:28 Travis.CG

Az idei R meetup középpontjában a bioinformatika volt. Az első meghírdetett nap nem volt jó nekem, ezért nem foglalkoztam vele, hiába jött kétnaponta a levél, hogy valaki adjon már elő az eseményen. Valószínűleg nem találtak embert, mert technikai problémára hivatkozva későbbre tolták a találkozót. Ez az időpont viszont megfelelt nekem.

Még az is megfordult a fejemben, hogy akár előadást is tarhatnék. Egy könnyedebbet arról, hogy néha jó, ha nem R-t használunk. A tervemet elküldtem, amit el is fogadtak.

El is jött a nagy nap. Ha szigorúan vesszük, akkor két előadás volt csak bioinformatika témájú. Egy AlphaFold-os és egy single cell-es. Ezen kívül egy erdészeti, egy orvosi és az én ismeretterjesztő előadásom volt. Öt embert sikerült összeszedni, ebből csak ketten beszéltek kifejezetten R-ről.

A hallgatóság nagy része sem bioinformatikus volt, inkább adattudomány területről jöttek és cégek alkalmazásában álltak. A beszélgetésekből azt szűrtem le, hogy legtöbben Python-t használnak, nem R-t, az már csak nosztalgia számukra.

Úgy néz ki, sokáig már nem érdemes R-el sem foglalkozni. A régi istenek meghaltak.

1 komment

Címkék: bioinformatika

A bejegyzés trackback címe:

https://cybernetic.blog.hu/api/trackback/id/tr8518384935

Kommentek:

A hozzászólások a vonatkozó jogszabályok  értelmében felhasználói tartalomnak minősülnek, értük a szolgáltatás technikai  üzemeltetője semmilyen felelősséget nem vállal, azokat nem ellenőrzi. Kifogás esetén forduljon a blog szerkesztőjéhez. Részletek a  Felhasználási feltételekben és az adatvédelmi tájékoztatóban.

sdani 2024.04.29. 10:48:15

Sajnos nekem is hasonló érzéseim vannak az R kiszorulásával kapcsolatban. Remélem jobban fogja tartani magát, mint a Perl. Mostanában egyre gyakoribb, hogy egy R-ben publikált megoldás Python implementációja nagyon gyorsan megjelenik. Mivel a két nyelv azért elég hasonló, gyakran ésszerűbb újra implementálni, mint fenntartani egy R komponenst a pipeline-ban (mindenféle környezettel együtt).

Pedig az R függvényábrázoló képességét imádom... főleg azután, hogy eleinte Perl-ben, gnuplot scripteket generáltam, amit azán külön kellett renderelni.
süti beállítások módosítása