Az élet kódjai

Jessica Chang: Transforming gene discovery by radically open data sharing A humán gének 51%-áról nem tudni, milyen hatással van a fenotípusra. Az újgenerációs szekvenálásoknak és a bioinformatika fejlődésének hála a felfedezések száma ugrasszerűen megnőtt. A következő 15 évben valószínűleg megugrik…

Legfrissebb megjelent publikációnk igazi fejes ugrás az ismeretlenbe, mert a plazmidok és azok funkcionális elemeinek a keresése közben olyan módszerrel dolgoztunk, ami nem csak, hogy kiforratlan, de azon kívül, hogy "tök baró", nem is tudtunk semmit. Igen, a MinION szekvenálóról van szó. Mint…

A korábbi Nanopore-os írásaim felkeltették az illetékesek figyelmét, valahogy összekapcsolták azokat az egyik munkatársammal és udvariasan figyelmeztették, hogy el kellene távolítani a blogbejegyzéseket. Szerencsétlen nem tudott az egészről semmit. Miután kiderült, hogy én voltam…

Elérkeztünk a burn-in lépéshez. Ennek során egy ismert szekvenciájú lambda fágot kellett megszekvenálni. Ez még a teszt része és a protokolok begyakorlására is kiválóan alkalmas. Mivel nálunk két készülék is van, elég adatot tudtam gyűjteni az elemzésekhez és alaposan begyakorolhattam, mire is kell…

Az első teszt futás felhő-alapú szekvencia meghatározása nem sikerült. A sablon szerű válaszok, amit a támogató csapat küldött azt akarta bemesélni nekünk, hogy bizonyára a könyvtárak jogosultságával lehetett a probléma. Igaz, hogy nem értek a Windowshoz, de azért ez elég furcsa válasz…

Az intézetünkből ketten is csatlakoztak a MinION teszt programhoz. A résztvevők mindegyike kapott egy MinION szekvenáló berendezést tesztelési célból. A kötelező tesztek lefuttatása után a készüléket arra használhatja az ember, amire akarja. Természetesen folyamatos visszajelzéseket és cikkeket…