HTML

Az élet kódjai

Csináld maga. Senki nem csinálja meg helyetted.

Friss topikok

  • sdani: Sajnos nekem is hasonló érzéseim vannak az R kiszorulásával kapcsolatban. Remélem jobban fogja tar... (2024.04.29. 10:48) R meetup
  • sdani: Nagyon jók ezek a bejegyzések! Feszültséggel teli, fordulatos, mint egy jobb krimi. :D Abba ne hag... (2024.04.29. 10:35) Wgel CTF
  • sdani: @Travis.CG: Egy kis szerencse sosem árt. :D (2024.03.01. 13:19) A bioinformatika helyzete 2024-ben
  • Travis.CG: Szóval az akadémiai szféra mazochistává tett, amit a Pinephone-al élek ki? Hmm, érdekes összefüggé... (2023.10.05. 18:23) Új barátom az Informatikai titkárságról
  • Travis.CG: Túl nagy a hype körülötte, ezért túlzó elvárások vannak vele szembe. Ha a korábbi chatbotokhoz kép... (2023.02.28. 06:28) chatGPT, a bioinformatikus

Segítségnyújtás

2015.07.21. 21:44 Travis.CG

Legújabb cikkünk  egy együttműködés keretében született. Megkerestek az állatorvosok, hogy segítsünk nekik egy Staphylococcus genom összeszerelésében és mutassuk meg nekik a felhasznált bioinformatikai módszereket is. A Mira-t hasznaltuk, de megpróbálkoztunk különböző scaffolderekkel is, hátha sikerül alacsonyabb scaffold számot kapni. Végül az így kapott eredményeket elvetettük.

Kezdetben tényleg nagyon lelkesen látogattak minket. Még egy kis finom noszogatást is kaptunk: ("A főnököm nagyon szeretné látni az eredményeket, de mondtam neki, hogy ehhez idő kell."). Mikor tényleg megkaptak minden eredményt, hirtelen eltűntek és a cikk nagyon nem akart megjelenni. A levelekre csak olyan válaszokat kaptunk, hogy most nagyon elfoglaltak. Oktatni kellett, beteg nyuszikat istápolni, stb. Javasoltam, hogy legalább a szekvenciákat töltsük fel. Ezt sem akarták, mert attól féltek, a szemfüles kínaiak megneszelik és cikket írnak belőle. Legalább ők akarnak cikket írni.

A bioinformatika oktatás sem lehetett túl sikeres, mert végül eljutottak oda, hogy ez a Linuxos parancssoros időtöltés nem gyümölcsöző, de a Geneious bezzeg kiváló program, nekem is azt kellene használni.

Már kezdtem teljesen lemondani róla, hogy ebből valaha publikáció lesz, amikor váratlanul megint elkezdtek özönleni a levelek. Hirtelen mindent fel kellett tölteni, kéziratot átnézni, sebtében többszörös illesztéseket végrehajtani. Kérdeztem is, mi ez a nagy pálfordulás, már nem félnek a kínaiaktól? Természetesen féltek, de a főnökségtől még jobban, akik eredményeket akartak látni.

Összességében nem volt rossz projekt. Már csak olyan cikkek kellenének, amiknek impaktja is van.

Szólj hozzá!

Címkék: publikáció

A bejegyzés trackback címe:

https://cybernetic.blog.hu/api/trackback/id/tr717645490

Kommentek:

A hozzászólások a vonatkozó jogszabályok  értelmében felhasználói tartalomnak minősülnek, értük a szolgáltatás technikai  üzemeltetője semmilyen felelősséget nem vállal, azokat nem ellenőrzi. Kifogás esetén forduljon a blog szerkesztőjéhez. Részletek a  Felhasználási feltételekben és az adatvédelmi tájékoztatóban.

Nincsenek hozzászólások.
süti beállítások módosítása