Az élet kódjai

Vége a hosszú, fáradságos munkának. Kész a kézirat is. A munkatársak, akik eddig együtt, vállvetve kutatták az ismeretlent, hirtelen ellenségekké vállnak és megkezdődik a harc, hogy milyen sorrendben legyenek a szerzők nevei feltűntetve. De előtte még felmerül a kérdés: egyáltalán kit vegyünk…

Miután kiderült, hogy némi R szkripteléssel klikkelések ezreit tudom megspórolni, újabb búzás megbizatást kaptam. Maga a számítás nem volt bonyolult, hamar megvoltam vele. Utána viszont hosszú ideig nem történt semmi olyan, amihez a segítségem kellett volna. A publikálás itt is nehezen ment. Talán…

Legfrissebb megjelent publikációnk igazi fejes ugrás az ismeretlenbe, mert a plazmidok és azok funkcionális elemeinek a keresése közben olyan módszerrel dolgoztunk, ami nem csak, hogy kiforratlan, de azon kívül, hogy "tök baró", nem is tudtunk semmit. Igen, a MinION szekvenálóról van szó. Mint…

Következő bejegyzés olvasása közben javaslom ennek a hallgatását. Végtelenítve, ha lehet. Szerencsés vagyok olyan szempontból, hogy mindig épp időben kapcsolódok bele egy-egy munkába. Ez volt a mangalica cikknél is és ez történt itt, a Sangerben is. A munka nehezét, vagyis az egerek felnevelését,…

Végre megjelent a Science Nature Genome Biology BMC Genomics cikk. Az egész úgy kezdődött, mint egy mese: Egy PhD hallgató töménytelen mennyiségű chip-seq illesztés nézegetése után furcsa anomáliára lett figyelmes: A CTCF kötőhelyek orientációja bizonyos szabályszerűséget mutat. Nem volt terabyte-os…

Észre sem vettem, hogy még egy cikkem megjelent. Őszintén szólva teljesen megfeledkeztem erről a munkáról, csak a mindent behálózó internetnek köszönhető, hogy ez az apró sziporka feledésbe nem merült. Ez egy elég marginális projekt volt, régen is történt, ezért elképzelhető, hogy nem minden…

Jobb ha van, de ha nincs, akár egy cikk is születhet belőle. Pontosan ez történt ugyanis a legújabb publikációnknál. A búza mikroRNS szekvenáláshoz a könyvtár előkészítést egy PhD hallgatónak kellett volna csinálni, de az egyik szenior kutató úgy gondolta, bölcsebb, ha nem tesz fel mindent egy lapra…

Megszületett életem eddigi legkellemetlenebb, legzűrösebb, legutálatosabb, legmegalázóbb munkájából a cikk. Az egész 2012-ben kezdődött, amikor visszatértem az akadémiai szférába. Ez volt az első projekt, amibe bekapcsolódtam és itt szereztem meg a rutint a mikroRNS-ek elemzéséhez. Minden nagyon…

Legújabb cikkünk  egy együttműködés keretében született. Megkerestek az állatorvosok, hogy segítsünk nekik egy Staphylococcus genom összeszerelésében és mutassuk meg nekik a felhasznált bioinformatikai módszereket is. A Mira-t hasznaltuk, de megpróbálkoztunk különböző scaffolderekkel is, hátha…

Kezdenek beérni a munkák. Hosszú pangás után beindult az impakt faktor gyár. Eddig ezzel a cikkel volt a legkevesebb problémám. Ez annak is köszönhető, hogy az első revízió után kapcsolódtam be a munkába. A vizsgálatok során öt búzafajta kb. 20 metabolit szintjét mérték két évjáratban, három…

Sok tekintetben a kutatás egyfajta versenyfutáshoz hasonlít, ahol az első helyezetten kívül nincs díjazás. Szerencsére elég sok versenyszám van, de így is tetemes mennyiségű kutató áll rajthoz. Hogy tovább növeljem a képzavart, néha csak akkor látjuk a konkurenciát, amikor az már célba ért és minket…